Lo que la ciencia sabe, y todavía no sabe, sobre la variante Omicron

¿Es más transmisible (comprenda: infeccioso) que la variante delta?

Son las mutaciones de la variante Omicron las que determinarán la capacidad de la variante de ser infecciosa o no, y de evitar, o no, la inmunidad adquirida gracias a las vacunas (ver explicaciones a continuación). Los datos epidemiológicos preliminares, aún no confirmados, indican que Omicron es más transmisible que Delta.

Sobre esta base que ambos Organización Mundial de la Salud ese Centro europeo para la prevención y el control de enfermedades Decidí clasificarlo entre las variables “perturbadoras” (Variables de interéscompuestos orgánicos volátiles).

Para una variable que se coloca en esta clase, El sitio web de la Organización Mundial de la Salud explica, debes:

  • Un aumento en la transmisibilidad o cualquier otro cambio negativo en la epidemiología de COVID-19. Con base en las pistas de este efecto, los expertos han clasificado a Omicron entre los compuestos orgánicos volátiles.

  • Aumento de la virulencia – enfermedad más grave o más grave que es más letal – o un cambio en la presentación clínica de la enfermedad – aún no se sabe si este es el caso.

  • o una disminución de la eficacia de las medidas de salud pública, incluida la vacunación.

La Organización Mundial de la Salud dijo en un comunicado el 29 de noviembre:

“El riesgo general asociado con Omicron se considera muy alto por varias razones. Primero, el riesgo general de Covid-19 sigue siendo muy alto en general, y segundo, hay evidencia preliminar preocupante para Omicron que, a diferencia de los VOC anteriores, sugiere el potencial de escape inmunológico y una mayor transmisibilidad, lo que podría dar lugar a nuevos brotes con graves consecuencias.

Los datos utilizados en esta evaluación son muy inciertos y se actualizarán a medida que haya más información disponible “.

Los datos de la provincia de Gauteng, proporcionados por el Departamento de Salud de Sudáfrica, estimaron que Omicron parece ser al menos un 30% más transmisible que la variante delta, que prevalece en el resto del país. El número efectivo de reproducción epidémica (Re) es en realidad 1,9 allí, frente a 1,5 en el resto del país. Pero el margen de error en esta figura aún debe evaluarse y las estimaciones deberán aclararse.

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En dos semanas, la variante B.1.1.529 (en azul) se hizo frecuente en Sudáfrica, impulsada por un resurgimiento en Gauteng. | Fuente: Ministerio de Salud de Sudáfrica.

Para muchos científicos, incluido el epidemiólogo de Berna Christian Althaus, quien habló en twitter, estas observaciones parecen indicar la ventaja del envío sobre delta.

El profesor Tulio de Oliveira, bioinformático y miembro del Consorcio de Monitoreo del Genoma de Sudáfrica que identificó la variante, señaló: en una conferencia de prensa 25 de noviembre:

“Esta variante realmente nos sorprendió, hay un gran salto en el desarrollo [de l’épidémie] Y muchas más mutaciones de las que esperábamos. Contiene muchas mutaciones molestas y es probable que se transmita muy rápidamente. Esperamos ver presiones sobre el sistema de salud en los próximos días y semanas “.

En otras palabras, todos los ojos estarán puestos en Sudáfrica y su sistema de salud durante los próximos días. Pero no es seguro que esto pueda predecir el futuro de la variante en otros lugares, particularmente en Europa Occidental, donde la cobertura de vacunación es bastante buena. No está claro hasta qué punto las vacunas en el mercado todavía protegen contra Omicron. Sudáfrica está pobremente inmunizada ya que, como todos los países africanos, ha luchado para obtener vacunas Covid-19 en masa. de acuerdo a Datos oficiales, El 38% de la población adulta de Gauteng está vacunada: un tercio con Janssen y dos tercios con Pfizer.

Cabe señalar, sin embargo, que esta nueva variante se descubrió temprano debido a que el país posee enormes capacidades de secuenciación genética.

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Descubra la alternativa. Se identificó por primera vez en Botswana el 9 de noviembre y ahora está circulando en Sudáfrica. La variante Omicron fue identificada el martes 23 de noviembre por la Agencia Sudafricana de Enfermedades Infecciosas (NICD), basándose en muestras tomadas entre el 12 y el 20 de noviembre en la populosa provincia de Gauteng.

Los científicos sudafricanos también sospechan que la alternativa ya se está extendiendo silenciosamente en el país.

¿La vacuna protege contra Omicron?

No se sabe si Omicron es total o parcialmente resistente a las vacunas. Con Delta, por ejemplo, la eficacia de las vacunas de ARN se ha reducido al 60-70%. Este número aún no se ha determinado para Omicron. Ya se están realizando investigaciones para responder a esta pregunta crucial.

  • Pfizer-BioNTech ha anunciado que ha lanzado un estudio, cuyos primeros resultados deberían conocerse “en un plazo máximo de dos semanas”.

  • Por su parte, Moderna ya anuncia estrategia Adaptar su vacuna a esta nueva alternativa lo antes posible.

Tampoco está claro qué tan bien Omicron puede eludir la inmunidad adquirida de una cepa anterior. Pero la Organización Mundial de la Salud Monumentos “Mayor riesgo de reinfección” basado en “datos preliminares” no especificados.

¿Se está propagando realmente el virus por Europa?

Sí, en serio. La variante se ha detectado en muchos países, especialmente en Bélgica, los Países Bajos, Italia y posiblemente Suiza. en Escocia, Se detectaron seis casos En personas sin antecedentes de viajes a Sudáfrica, lo que sugiere que la variante ya se está extendiendo en la población.

¿Omicron sobrevive al diagnóstico?

La buena noticia es que esta variante sigue siendo detectable con las pruebas de PCR rápida que se utilizan para detectar Covid-19. Las pruebas de PCR ThermoFisher Taq Patch, que se basan en la detección de tres genes diana, son capaces de identificar la variante.

  • Debido al gran número de mutaciones en el segmento del genoma asociado con la proteína de pico, no fue reconocida por PCR.

  • Por otro lado, otras partes del genoma diana se detectaron comúnmente por PCR, con una carga viral alta (CT <30).

Este patrón de detección, apodado ‘fuga del gen S’, hace posible identificar fácilmente la variante, a la espera de más pruebas específicas. Esto es lo que el Consorcio de Monitoreo de Sudáfrica (NGS-SA) hizo posible descubrir en un tiempo récord.

La identificación de una variante para la detección es una herramienta esencial para frenar su propagación, mediante el rastreo de contactos y la cuarentena.

¿Qué sabemos sobre las mutaciones omicron?

Mutaciones en la cepa B.1.1.529 – el nombre científico dado a la variante Omicron en notación banjo – Mas de 50.

Más de 30 de ellos se relacionan con la famosa proteína de pico, que permite que el virus penetre en las células humanas. También es esta proteína a la que se dirigen los anticuerpos de la vacuna.

  • Entre los picos, algunos tienen Ya notado en otras variantes asociado con un aumento de la infección. Otros, para aumentar la resistencia de anticuerpos efectivos contra cepas anteriores o la capacidad de interferir con el sistema inmunológico.

  • La variante también contiene tres mutaciones ubicadas en otro sitio muy sensible del genoma, llamado escisión forin. Estas mutaciones parecen estar asociadas con una mejor capacidad para infectar a los humanos.

  • Otras mutaciones identificadas en el genoma omicron son raras y no se comprenden bien en esta etapa.

  • La gran cantidad de mutaciones e inserción de ARN humano sugiere que esta nueva variante podría surgir después de una larga evolución en un paciente inmunodeprimido, como es sin duda el caso de Delta.

  • Observamos, en el gráfico de evolución a continuación, el salto evolutivo asociado con Omicron (en rojo oscuro).

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opinión experta. El profesor Didier Trono, Jefe del Laboratorio de Virología y Genética de la EPFL, explicó el 26 de noviembre:

“El aumento de mutaciones es asombroso. Nosotros mismos estamos analizando actualmente el efecto sobre la infección y la sensibilidad de los anticuerpos a esta nueva variante. En pocas palabras, todavía no tenemos ningún resultado, y lo sé en otros lugares también. Sabremos más en En los próximos días, en particular, probaremos los anticuerpos El anticuerpo monoclonal que desarrollamos con CHUV, sueros vacunados y tratados en Suiza ”.

Imagen de robot de la proteína mutada. La capacidad de la variante para infectar células también depende de la conformación espacial de la proteína espiga.

Investigadores italianos del Hospital Bambino Gesu en Roma entregaron el primer modelo 3D el 27 de noviembre de 2021, basado en la secuencia genética omicron de la proteína Spike modificada. Las regiones en rojo muestran un contraste muy alto.

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hospital bebe jesus

Los investigadores italianos han La principal agencia de noticias italiana informó El 27 de noviembre, las mutaciones “se concentran principalmente en una región de una proteína que interactúa con las células humanas”. Pero indicaron que:

“Esto no significa automáticamente que estas diferencias sean más graves, simplemente que el virus se ha adaptado más a la especie humana al generar otra variante (…) Otros estudios nos dirán si esta adaptación es neutra, menos peligrosa o más peligrosa. “

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Colaboradores de este artículo: Evan Pandeli, Sarah Sirmunddad, Annick Chevelot

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