La flora intestinal ahora es segura en Suiza
Las muestras de heces se preparan en placas de Petri para su análisis. swissinfo.ch
El Covid-19 nos quiere mal. Sin embargo, en nuestro intestino se multiplican muchos virus, bacterias y otros microorganismos, que son necesarios para nuestra existencia. Gran esperanza en la medicina. Como los científicos quieren preservar esta joya, el microbioma planetario es ahora un refugio en Suiza.
Este contenido fue publicado el 27 febrero 2022 – 11:45
Michelle Andina
bloque de trabajo. Un robot de secuenciación instalado en el laboratorio del Hospital Universitario de Basilea analiza la información genética de bacterias extraídas de decenas de muestras fecales simultáneamente. Las muestras, que fueron entregadas al laboratorio en pequeños tubos, provienen de turistas que regresaron de la India.
«Recibimos estas muestras de todo el mundo», dice Adrian Egli. El médico dirige el departamento de bacteriología y micología (micología) y actualmente está realizando los primeros ensayos de Proyecto internacional «La Bóveda de la Microbiota»Enlace externo (o seguro para microbióticos).
Un robot de este tipo hace posible secuenciar muestras y, por lo tanto, hacerlas legibles. swissinfo.ch
En definitiva, se trata de catalogar el microbioma global -es decir, todos los microorganismos- dentro de un archivo gigante. Y guárdalo para las generaciones futuras. El ser humano es el foco del proyecto, porque la flora intestinal afecta severamente nuestra salud y psique. El problema es que la urbanización y los cambios ambientales amenazan la diversidad microbiana en todo el planeta.
Adrian Egli espera que las muestras de la India arrojen luz sobre los cambios en la composición de las bacterias en el intestino. ¿Y cómo se relaciona todo esto con la propagación de la resistencia a los antibióticos? Cabe señalar que después de un viaje a Asia, las muestras pueden contener múltiples bacterias resistentes a los antibióticos que pueden representar un peligro para todos nosotros.
La composición de la flora intestinal afecta a la salud y permite sacar conclusiones sobre el estado de salud de una persona. Una persona adulta alberga cientos de especies de bacterias que juntas pueden pesar hasta dos kilogramos. Dos kilogramos afectan fuertemente el metabolismo. El proyecto «Microbiota Vault» tiene como objetivo comprender mejor estas complejas relaciones.
En el laboratorio, una muestra contiene miles de millones de microorganismos, por lo que unos pocos gramos son suficientes para la secuenciación. «Separamos las muestras de heces en pedazos pequeños y los congelamos», explica Adrian Egli. Esto ayuda a determinar las mejores condiciones de almacenamiento para una muestra determinada”.
preservar la diversidad
Desde el éxito de las obras circulares La magia del intestino (2015 en traducción al francés), parte de la población es consciente de esta realidad. Nuestro intestino es el hogar de billones de microorganismos que no solo nos ayudan con la digestión, sino que también realizan una increíble variedad de «funciones» en nuestros cuerpos. Contribuyen, por ejemplo, a la absorción de vitaminas y a la activación de nuestro sistema inmunológico.
Transformamos nuestros alimentos a través de muchas reacciones químicas. Pero, según los expertos, solo una parte de estos procesos los llevamos a cabo por nuestra cuenta. Los microbios proporcionan una buena parte de ella.
Para nuestro sistema inmunológico, su normal desarrollo no puede prescindir de la microflora intestinal. Microbios cuya diversidad es una necesidad desde el punto de vista de la salud. Por extensión, un microbioma rico en diversidad se refiere a humanos y animales sanos.
Adrian Egli, del University Hospital Basel, lidera actualmente la fase piloto del proyecto internacional «The Microbiota Vault». El biólogo es el jefe de especialidad del Departamento de Bacteriología Clínica/Micología. swissinfo.ch
Como lo que ya está hecho para las plantas con extensión. «Tienda global de semillas en Svalbard»Enlace externoEl proyecto sin ánimo de lucro «The Microbiota Vault» tiene como objetivo recopilar y categorizar todo el microbioma humano y animal. También se ocupa de los microbios de los alimentos fermentados de los que la medicina espera obtener una cierta cantidad de conocimiento. Las bacterias del ácido láctico en particular serán beneficiosas para nuestra salud.
Gestión de proyectos en Suiza
Junto a Dominik Steiger, otros dos especialistas forman parte del equipo de gestión multidisciplinar en Suiza. Ellos son Pascal Vonaish, de la Universidad de Lausana, y Nicholas Bukolić, de ETHZ.
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“La diversidad del microbioma está en riesgo”, dice Dominic Steiger, curador de la iniciativa The Microbiota Vault, que lidera la primera fase del proyecto. La explicación está en la transformación de los estilos de vida: la urbanización, la globalización, el rápido desarrollo de las condiciones de vida de las comunidades indígenas, la modificación de los ecosistemas en relación con el cambio climático y la destrucción de los hábitats naturales…
Estos cambios conducen a la rápida consolidación del microbioma en nuestro intestino. “Estamos perdiendo su diversidad en un momento en que recién comenzamos a comprender su importancia”, lamentó Dominic Steiger. En otras palabras, es hora de actuar.
A salvo de gérmenes
Esta observación es compartida por Andrew Macpherson, de la Universidad de Berna. Como parte de sus proyectos de investigación, trabaja en las interacciones entre humanos y microbios. El científico no está directamente involucrado en el proyecto pero conoce a todos los actores y actrices.
«Si queremos hacer algo, ahora es el momento», dijo. Esta es la razón de mi total apoyo a este proyecto, que he discutido con el equipo fundador, así como con varios colaboradores existentes.”
«Estamos perdiendo su diversidad en un momento en el que apenas comenzamos a comprender la importancia del microbioma».
Dominic Steiger, director del proyecto «La Bóveda de la Microbiota»
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El objetivo es conservar y clasificar la diversidad microbiana global, para poder estudiarla mejor. Dominic Steiger destacó la importancia de construir un sistema común para los países ricos y pobres, «basado en la equidad y los beneficios mutuos».
Está claro que los investigadores suizos no deben estar solos en la recolección, secuenciación y catalogación de muestras, sino que deben colaborar con colegas del resto del mundo y la red de colecciones existentes.
Dominic Steiger explica que la peculiaridad de nuestra iniciativa es que todos los depositantes, es decir, todos los grupos locales, siguen siendo soberanos sobre las muestras que almacenan con nosotros. como apoderado.
La elección de Suiza
La idea del proyecto proviene de un grupo internacional de investigadores de microbiomas, los autores de un Artículo sobre este temaEnlace externo Publicado en la revista saber. a Estudio de factibilidadEnlace externo Permitió comparar entre diferentes sitios posibles. Al final, «The Microbiota Vault» eligió Suiza.
Pero Dominik Steiger especifica que la elección del lugar no es excluyente. El proyecto comenzó en Suiza a finales del año pasado. Allí colaboran científicos de la Universidad de Rutgers en Nueva Jersey (EE.UU.), el Instituto Federal Suizo de Tecnología en Zúrich (ETHZ) y las Universidades de Basilea y Lausana.
«Este proyecto es una gran oportunidad para Suiza».
Adrián Egli, Doctor
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En el frente financiero, los empresarios internacionales, incluidos dos ganadores del Premio Nobel, recaudaron 1 millón de francos. Cuatro fundaciones (Gebert Rüf Stiftung, Seerave Foundation, Rockefeller Foundation, Oak Foundation) proporcionan la mayor parte de las contribuciones.
Adrian Egli, del Hospital Universitario de Basilea, explica que considerar tal empresa, que ha sido planeada durante décadas, requiere su estatus en un país estable y neutral. También es una cuestión de poder tener los medios y capacidades para describir las muestras a la perfección. «Este proyecto es una gran oportunidad para Suiza».
Las muestras de microbios deben conservarse en dichos tanques para las generaciones futuras. swissinfo.ch
en el laboratorio
De vuelta en el laboratorio, la muestra está lista para su almacenamiento. El empleado abre un refrigerador gigante donde hay un frío constante de menos 80 grados. La gruesa capa de hielo demuestra perfectamente este almacenamiento a temperaturas muy bajas. Se trata de trabajar de forma rápida y segura para proteger su piel.
“Las bacterias no se pueden congelar sin más, van a morir”, define Adrián Egli. Los cristales son letales para la célula bacteriana. Entonces se agregan conservantes especiales que le permiten sobrevivir en el estado de congelación. Un proceso que actualmente se está identificando en la fase piloto del proyecto «The Microbiota Vault».
¿Qué pasa con la seguridad y la calidad de tal acumulación de microbios? ¿No hay, a la larga, riesgo de contaminación o cambio? Según Adrian Egli, las muestras deben describirse con la mayor precisión posible utilizando métodos estandarizados y reconocidos internacionalmente. Esto es para mostrar si es probable que esta muestra contenga resistencia a los antibióticos o toxinas. Los patógenos también se congelan por separado.
El concepto de calidad de «Microbiota Vault» también incluye la verificación de cualquier cambio en la composición de las muestras almacenadas. La muestra en realidad puede variar durante el proceso de congelación. Es por eso que la diversidad de bacterias presentes cada vez debe documentarse con precisión utilizando el mismo método. Antes de enfriar, por supuesto, pero también durante la descongelación, para detectar cualquier cambio.
Según el científico, la documentación precisa y personalizada de las muestras es un componente esencial del proyecto. «Usar el mismo vocabulario en todas partes es importante, al igual que en el idioma. No puedo recuperar nada cambiando constantemente del alemán al francés y viceversa», explica Adrian Egli.
A largo plazo, un antiguo búnker militar en los Alpes suizos podría albergar unas 100.000 muestras para su almacenamiento. “Pero esto requiere mucha inversión”, explica el investigador. Tardará algunos años más en llegar».
Reconocimiento a la investigación
Tres investigadores de la Universidad y el Hospital Universitario de Berna recibieron el Premio Pfizer a principios de este año por su trabajo conjunto. Mostraron cómo nuestras bacterias intestinales influyen en la formación de anticuerpos.
El Premio Pfizer es uno de los premios de investigación médica más importantes de Suiza. Se otorga anualmente en cinco áreas de investigación por recomendación de comités científicos independientes.
(Fuente: Universidad de Berna)
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