El virus mutó: he aquí por qué descubrió a los ingleses antes que otros

Cuando busca … encuentra, no es una coincidencia que los británicos hayan identificado un nuevo tipo de virus en su suelo antes que sus vecinos europeos. En términos de secuenciación del genoma, ya son estándares a escala mundial.

Los británicos fueron los primeros en advertir sobre la aparición de un nuevo tipo de virus potencialmente más contagioso. Como indica Olivier Ferrand, es muy probable que esta mutación ya se haya extendido, ya sea en Francia o en otros lugares de Europa. Si Italia ya lo ha descubierto en su territorio, todavía no es el caso en Francia. Una situación que sorprende necesariamente porque la capacidad del estado para identificar nuevas variantes depende directamente de su regulación respecto a la secuencia del genoma del virus, es decir, su capacidad para determinar con precisión la “tarjeta de identidad” del virus. Para encontrar, como era de esperar, tienes que buscar. En este punto, Gran Bretaña parece estar mejor equipada.

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La secuencia es 100 veces más que en Francia

La alternativa que hoy preocupa a los investigadores habría surgido hace varias semanas. Un elemento que llamó la atención del internauta y científico de datos de profesión, quien expresó en Twitter su sorpresa por el hecho de que tal boom aún no se hubiera identificado en Francia. Después de investigar un poco, se dio cuenta de que nuestros vecinos británicos están realizando demasiadas secuencias del genoma del SARS-CoV-2. “100 veces más que Francia”, Él dice. Esta observación está respaldada por gráficos disponibles en GISAID, una plataforma de referencia donde los laboratorios que estudian el genoma comparten datos.

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¿Francia se está quedando atrás en la secuencia? No necesariamente, pero Gran Bretaña claramente tiene muchos avances en esta área, confirma Etienne Simon Laurier, Jefe del Laboratorio de Genómica Evolutiva para Virus de ARN en el Instituto Pasteur. Cuando LCI le preguntó, pensó que sí “Otros países habrían terminado descubriendo esta alternativa”.Pero los británicos, lo son “Descúbrelo casi en tiempo real. Tienen un sistema de vigilancia realmente asombroso”.

prácticamente, “Son los únicos en el mundo de hoy que están secuenciando de esta manera rápida y coordinada en todo su territorio. Decidieron con suficiente tiempo crear una federación y expandir su organización a una escala: Bretaña. Hay muy pocos países que han podido hacer lo mismo”. Un sistema probado que impresiona al investigador: “Lo bueno es que todo es central. Muchos laboratorios lo serializan usando sus propios métodos, y luego comparten todos los datos. Se recopilan y analizan juntos casi en el momento adecuado. Real. Es realmente gigantesco”. Por lo tanto, esta diferencia (de 1 a 100) se implementó en el tamaño de la secuencia.

“en Francia”Etienne Simon Laurier continúa, ‘Programas espontáneos e independientes’ Existente. “Al mismo tiempo, las NRC, especialmente en París, han estado recopilando y compartiendo datos en tiempo real desde el principio, pero no están recibiendo una fracción masiva del número de casos. No sería necesariamente excesivamente representativo. Unas semanas más para ver si la alternativa se extiende en Francia. o no “.

Áreas para mejorar

En el contexto actual, reconocemos que la identificación rápida de la mutación es más que beneficiosa para adaptar eficazmente las medidas de salud y responder. Por tanto, el sistema británico puede servir de modelo para el futuro. Especialmente en Francia, parece posible avanzar en la recopilación de información. Un especialista del Instituto Pasteur familiarizado con la plataforma GISAID señala algunos elementos interesantes. Note que hay “Con frecuencia, los laboratorios depositan todas sus secuencias a la vez”.. Así recuerda el laboratorio que se introdujo a principios del curso escolar “Todo lo que logró entre marzo y septiembre”. Si los datos “Los muy modernos son útiles, pero las aplicaciones que tienen varios meses son mucho menos”., El buscador se desliza.

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En el futuro, la forma en que el trabajo de búsqueda también podría evolucionar, particularmente con respecto al intercambio de datos. Hoy en día, estos no necesariamente se comparten dentro de la comunidad científica de forma automática. Esto significa que, en la práctica, muchas de las secuencias del SARS-CoV-2 podrían realizarse en Francia sin llamar la atención de los investigadores miembros de otros laboratorios. Si esto pudiera explicarse por la intensa competencia en el sector de la investigación, probablemente dificultaría la comprensión del virus e impediría el análisis de la dinámica detrás de su propagación. El sistema británico, del que Etienne Simon Laurier se benefició ‘Gran financiación’Tiende a mostrar que una red importante mezclada con un centralismo sistemático resulta virtuosa, especialmente durante una crisis como la que se vive actualmente en Europa y el mundo.

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